9、小時候畫了那張殺人的畫怎麼解釋呢？
小時候那張殺人的畫當然是未來的他回去畫的，因為那時他已經有了殺死了兩個罪犯的想法，所以在回去刺傷雙手留下疤痕之前畫了那幅畫。這也說明了為什麼小時候他根本不記得為什麼畫了那幅畫，因為那是未來的他畫的；同理，他回廚房裏拿刀准備去毀了炸藥時，他媽過來了，驚醒後不記得為什麼拿刀了，一個意思。
2《蝴蝶效應》疑問大全
10、主角父親為何要殺自己的兒子？
因為他知道越改變會越糟，他兒子也會一樣，並且有可能會傷害他妻子，所以他決心殺自己的兒子。
11、回到畫畫的時候，弄傷自己的手為何未改變未來，是否不符合蝴蝶效應？
兩個疑問：
1、現實中，刺穿自己的手如此重傷必然會去醫院，依照蝴蝶效應，這點將足夠被無限放大直至影響未來，但未來只是留下傷疤，是否不符合邏輯？
2、另外，主角弄傷自己的手是想留下傷疤給牢友看，好讓牢友相信他，幫助他要回日記，讓他改變過去可以使現在的他不用坐牢，這裏有個問題，既然已經回到畫畫時的過去，為什麼只用這個機會只去留一個傷疤，而不在畫畫時做一件不同於過去但足夠可以改變未來的事？這樣他依然不用坐牢。
這個問題也是網友們爭議最多的，可以這樣解釋，這個回去的機會，與拿刀准備去毀了炸藥時被媽媽阻止的那次機會差不多，兩個機會都是不具備絕對可以改變未來的機會。兩者都會回到過去，但是都沒有真正起到改變未來的作用，也就是說畫畫這段短暫喪失的記憶，所能給主角改變未來的機會僅僅是能給他留下兩個傷疤而已，只是比那次廚房裏拿刀准備去毀了炸藥好一些，因為那次媽媽阻止了他，沒有機會。同理，這次機會之短暫加上各種客觀因素，使他只能留下傷疤，看起來，他自己也很明白這點，因而要求牢友看清他的變化，以獲取信任。
12、平行宇宙是否能解釋《蝴蝶效應》？
盡管這樣，有些情節還是無法解釋：
比如：在醫生那裏做催眠，為何不能回憶起，導致第一次流鼻血；又如：煙頭掉在衣服上，在他肚子上燒了一個疤痕，如果這次回去改變了童年，使肚子上燒了一個疤痕，那為何七年後才發現；同理，回去改變了童年，刺穿自己的手，使手上有了兩個疤痕，為何當著牢友的面才出現，那童年時應該就有疤痕啊？去哪了？難道是拋棄了過程只看結果？
用平行宇宙來解釋就有答案，首先看看主角回去過去了幾次：
(1)、在宿舍念日記，突然回到湯米燒他的狗的場景，問了一句「我在哪裏」，但狗還是被燒死。
(2)、回到爆炸事件的現場，煙頭掉在衣服上，在他肚子上燒了一個疤痕，雷管爆炸，蘭尼被嚇傻了，回來後，發現肚子上確實有個疤痕。
(3)、凱麗自殺後，念日記，回到凱麗家地下室，凱麗的父親讓他們脫掉衣服，埃文告訴他，應該愛護凱麗，不要再碰凱麗，要多關心湯米，回來後，和凱麗在一起；殺死了湯米；到監獄。
(4)、監獄中，回到畫畫的時候，畫了殺人的畫，然後刺傷雙手，回到監獄，手上出現傷痕，奪回日記。
(5)、回到狗被燒死的時候，給蘭尼一塊鐵皮，讓他去救狗，他的話打動了湯米，把狗放了，蘭尼殺死了湯米。回來後，看到悲慘的蘭尼。
(6)、回到他見父親的時候，問他父親如何改變錯誤的事情，他父親說再這樣下去他會殺了他媽，他說他看過他父親的明信片，他能改變發生過的事情，他父親要殺他。回來，凱麗成了一個墮落的吸毒者和妓女。
(7)、他回到爆炸的時候，挽救了那個女人和孩子、回到宿舍，發現同室的是蘭尼，而和他**的是凱麗、發現自己雙臂殘疾，發現他媽得了肺癌。
(8)、回到家裏廚房，找到一把刀，准備毀了炸藥，那次媽媽阻止了他回到宿舍，沒有任何改變。
(9)、回到凱麗家地下室，拿到雷管，點燃雷管，卻炸死凱麗，回到醫院，去找醫生，要他的日記，醫生說根本沒有日記。
(10)、看錄像帶，回到母親分娩前，殺了自己。凱麗很幸福，蘭尼和湯米也都很成功，蘭尼和凱麗結婚。
我們現在將以上10個回到過去的情形定義為10個不同但平行的空間(1～10空間)，加上影片中最初的空間（定義為0空間），一共11個空間。看看發展過程：
0空間：電影中的一共13年，包括經常失憶的童年6年。在宿舍念日記，突然回到湯米燒他的狗的場景，問了一句「我在哪裏」，但狗還是被燒死。由於回到了過去，說了句話，改變了未來，於是來到1空間。
1空間：基本和0空間相同，雖然來到1空間，由於他有0空間的記憶，他就是0＋1空間的人。由於主角在來1空間的過程中只說了句話，對整個過程沒有影響。唯一的改變是主角的大腦裏多了一段可以通過念日記可以回到過去的記憶。之後通過念日記，回到0空間爆炸事件的現場，煙頭掉在衣服上，在他肚子上燒了一個疤痕，雷管爆炸，蘭尼被嚇傻了，回來後，來到2空間，發現肚子上確實有個疤痕。
3《蝴蝶效應》疑問大全
2空間：基本和1空間相同，雖然來到2空間，由於他有0＋1空間的記憶，他就是0＋1＋2空間的人，只是主角的肚子上多個疤痕。注意，這裏就可以解釋2空間的主角為何七年後才發現肚子上確實有個疤痕。因為2空間的他沒有被燒的經曆，因此之前沒有疤痕，1空間的他是通過0空間的失憶片段來到2空間，2空間的他瞬間才有了疤痕。由於凱麗自殺，念日記，回到0空間凱麗家地下室，凱麗的父親讓他們脫掉衣服，埃文告訴他，應該愛護凱麗，不要再碰凱麗，要多關心湯米，回來後，來到3空間。
3空間：由於凱麗的父親的改變，導致整個空間與2空間完全不同了，雖然來到3空間，由於他有0＋1＋2＋3空間的記憶，他就是0＋1＋2＋3空間的人，0、1、2的記憶瞬間植入3空間的他的大腦裏，因此流了鼻血。3空間他和凱麗在一起，口音和走路姿勢都變了，因為他已經不是3空間的人了，他是0＋1＋2＋3空間的人。後來他殺死了湯米；到監獄。為了讓牢友相信他，回到0空間畫畫的時候，畫了殺人的畫，然後刺傷雙手，回來後，來到4空間。
4空間：基本和3空間相同，只是主角的手上多個疤痕。道理和之前燒了一個疤痕一樣，4空間的他本身童年手上沒有疤痕，0＋1＋2＋3空間的他通過0空間的失憶片段刺傷雙手後來到4空間，4空間的他瞬間有了疤痕，說服了牢友，奪回日記，回到0空間狗被燒死的時候，給蘭尼一塊鐵皮，讓他去救狗，他的話打動了湯米，他把狗放了，蘭尼殺死了湯米。回來後，來到5空間。
5空間：和4空間又大不相同了。蘭尼殺死了湯米，主角看到悲慘的蘭尼。0、1、2、3、4的記憶瞬間植入5空間的他的大腦裏，因此又流了鼻血。回到0空間他見父親的時候，問他父親如何改變錯誤的事情，他父親說再這樣下去他會殺了他媽，他說他看過他父親的明信片，他能改變發生過的事情，他父親要殺他。回來後，來到6空間。